การใช้ยาปฏิชีวนะนำไปสู่ความเสียหายข้างเคียงต่อไมโครไบโอม ทำให้จำนวนยีนดื้อยาที่ส่งผ่านไปมาระหว่างสายพันธุ์ในไมโครไบโอมเพิ่มขึ้น ยีนเหล่านี้แพร่กระจายได้ง่ายผ่านประชากร ซึ่งไม่คำนึงถึงสุขภาพและนิสัยของคุณ จำนวนยีนต้านทานในลำไส้ของคุณได้รับอิทธิพลอย่างมากจากแนวโน้มการบริโภคยาปฏิชีวนะของประเทศภัยคุกคามที่ร้ายแรงที่สุดต่อสุขภาพของโลก
การดื้อยาต้านจุลชีพที่เพิ่มขึ้นในบรรดาเชื้อโรคในมนุษย์ถูกมองว่าเป็นหนึ่งในภัยคุกคามที่ร้ายแรงที่สุดต่อสุขภาพของโลกในทศวรรษหน้า เชื่อกันว่า AMR มีส่วนทำให้มีผู้เสียชีวิตหลายหมื่นคนในยุโรปในแต่ละปี การติดตามการเกิดขึ้นและการแพร่กระจายของยีนที่ช่วยให้เชื้อโรคเหล่านี้ยักไหล่จากยาปฏิชีวนะโดยทั่วไปจำกัดเฉพาะตัวอย่างที่นำมาจากผู้ติดเชื้อเท่านั้น อย่างไรก็ตาม จุลินทรีย์ส่วนใหญ่ที่อาศัยอยู่ในร่างกายมนุษย์ไม่ก่อให้เกิดโรค ไมโครไบโอมของมนุษย์เป็นชุมชนที่ซับซ้อนและมีพลวัตของจุลินทรีย์หลายล้านสายพันธุ์ ส่วนใหญ่อาศัยอยู่ในลำไส้และอยู่ร่วมกับเรา ไมโครไบโอมมีบทบาทสำคัญต่อสุขภาพและโรค โดยไมโครไบโอมในลำไส้เป็นที่ทราบกันดีว่าช่วยในการย่อยอาหารและการพัฒนาระบบภูมิคุ้มกันของเรา